​Como parte de su compromiso con la evolución y pertinencia de su labor, el Museo Nacional de Colombia ha llevado a cabo un proceso participativo y reflexivo para actualizar su misión. Este ejercicio ha permitido integrar diversas voces y perspectivas, garantizando que la misión del museo refleje su papel como institución clave en la preservación del patrimonio cultural y biocultural del país.

Desde finales de 2023, se llevaron a cabo diversos espacios de discusión y construcción colectiva para definir la nueva misión de la UAE Museo Nacional. En estos encuentros, participaron más de 80 personas en la sesión del 31 de octubre de 2023, con trabajadores del Museo Nacional en Bogotá; más de 20 participantes en la sesión del 7 de junio de 2024, con los trabajadores del sistema de museos; y más de 20 personas en la sesión del 22 de julio del mismo año, dentro del marco de la discusión sobre la misión del Museo Colonial, parte del Sistema de Museos de la UAE.

Como resultado de estos espacios, se elaboraron varios postulados que respondían a preguntas clave como:

¿por qué existimos?, ¿en qué creemos?, ¿qué deseamos lograr?, ¿qué hacemos?,¿Para quién lo hacemos? y ¿con quién lo hacemos? 

Como parte final del proceso, entre septiembre y diciembre del 2024, un comité redactor compuesto por diversos trabajadores del sistema de museos revisó y ajustó las propuestas con el objetivo de desarrollar un nuevo postulado que reflejara nuestra función como museo, sistema y en relación con el sector, alineado con las apuestas planteadas.​

Como resultado de los múltiples espacios realizados, la nueva misión de la UAE Museo Nacional de Colombia ​​es: